সিএএফও, নৌ-পরিবহন মন্ত্রণালয়, নৌ-পরিবহন মন্ত্রণালয়ের অধীনস্থ দপ্তরসমূহের অর্থ পরিশোধকালে কার্যকর পূর্ব নিরীক্ষা সম্পাদন করে থাকে। এছাড়াও ডিজিটালাইজেশনের মাধ্যমে গুনগতমানসম্পন্ন হিসাব প্রণয়নে সরকারী সিদ্ধান্ত বাস্তবায়নকল্পে সহযোগিতা প্রদান করে থাকে।
এ কার্যালয়ের কার্যাবলী ও সেবাসমূহ নিম্নরুপঃ
গেজেটেড কর্মকর্তাদের অনলাইন ব্যবস্থাপনায় বেতন বিল গ্রহণ এবং ইএফটি এর মাধ্যমে পরিশোধ করা।
কর্মচারীদের বেতন বিল, অন্যান্য আনুষঙ্গিক বিল, ভবিষ্য তহবিল হিসাব সংরক্ষণ ও হিসাব বিবরণী ইস্যুকরণ। যথাসময়ে অফিস ভিত্তিক মাসিক হিসাব ও উপযোজন হিসাব প্রণয়ন করা।
নির্ধারিত সমকয়ে পেনশন পরিশোধ করা।
কর্মকর্তা ও কর্মচারীদের বেতন নির্ধারণ ছুটির হিসাব প্রণয়ন, ভবিষ্য তহবিল হিসাব সংরক্ষণ ও হিসাব বিবরণী ইস্যুকরণ। যথাসময়ে অফিস ভিত্তিক মাসিক হিসাব ও উপুযোজন হি৮সাব প্রনয়ন করা।
মাসিক হিসাবের সংগতি সাধন করণ।
বাৎসরিক উপযোজন হিসাব প্রণয়ন পূর্বক প্রিন্সিপাল একাউন্টিং অফিসারে স্বাক্ষর গ্রহণ পূর্ব ভেটিং এর জন্য সিভিল অডিটে প্রেরণ করা।
নৌ- পরিবহন মন্ত্রণালয় এর প্রিন্সিপাল একাউন্টিং অফিসারকে আর্থিক পরামর্শ প্রদান করা।